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兩研究發現全新病毒基因 揭人類對病毒認知少之又少

2020/2/10 — 18:41

Yara 病毒,圖片來源:MICROSCOPY CENTER UFMG-BELO HORIZONTE

Yara 病毒,圖片來源:MICROSCOPY CENTER UFMG-BELO HORIZONTE

病毒是地球上其中一類最神秘的微生物,學界甚至有人質疑病毒並非生物。最新刊於 bioRxiveLife 的兩個研究同樣發現新病毒,而這兩種病毒的基因都未曾被記錄過。

刊於預印期刊 bioRxiv 的研究,由米納斯吉拉斯聯邦大學病毒學家 Jônatas Abrahão 領導。團隊原本在該國的人工湖尋找 400–800 微米長的巨型病毒,最終找到同會感染變形蟲、只有 80 微米長的 Yara 病毒。

大多數已知感染變形蟲的病毒都有共同基因特徵,可讓學界了解其演化過程;新發現的 Yara 病毒並無大的粒子與複雜基因組,但它們帶有超過 90% 、但此前無記錄過的「孤兒基因 (orphan gene) 」。

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團隊發現,只有六個發現的基因與現今數據庫中記載的病毒基因非常相似;而在對比超過 8,500 個已公開的元基因組 (metagenomes) ,也無發現與 Yara 病毒有密切關係的基因線索。團隊指,由於無法找到匹配的基因, Yara 病毒現時甚至不可以被視為病毒因子 (viral agent) 。

團隊在總結時指,構成 Yara 病毒顆粒的未知蛋白質數量,反映出病毒世界的變異性,相信有更多新的病毒基因組等待被發現。

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另一份由美國國家癌症研究中心病毒學家 Christopher Buck 領導的研究,則在動物組織中尋找可將基因圍成一圈的環狀病毒,這些病毒包括引起子宮頸癌的乳突病毒 (papillomavirus) 。

為找到這些病毒,團隊從人類和其他動物的數十種組織樣本中分離出病毒顆粒,篩選出環狀基因組。團隊總共發現了大約 2,500 種環形病毒,其中約 600 種是新發現的。報告指,目前尚不清楚新發現的病毒對人類健康有何影響。

兩個新研究的意義,不僅在於確定哪些病毒會引起疾病:某些生活在人體中的病毒可能有助於保持健康,另一些則對於幫助保持生態系統的平穩運行至關重要。無參與該兩個研究的溫哥華英屬哥倫比亞大學環境病毒學家 Curtis Suttle 更指,沒有病毒,我們就無法生存;發現新病毒與其特徵,對我們有莫大好處。

來源:
Science, Scientists discover virus with no recognizable genes, 7 Febraury 2020

報告:

  1. Boratto, P.V.M., Oliveira, G.P., Machado, T.B. & et al. (2020). A mysterious 80 nm amoeba virus with a near-complete “ORFan genome” challenges the classification of DNA viruses. bioRxiv 2020.01.28.923185; doi: 10.1101/2020.01.28.923185
  2. Tisza, M.J., Pastrana, D.V., Welch, N.L. & et al. (2020). Discovery of several thousand highly diverse circular DNA viruses. eLife 2020;9:e51971 DOI: 10.7554/eLife.51971

文/Alan Chiu 、審核/Edward Ho

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