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【武漢肺炎】中國團隊稱病毒有 2 個亞型 感染力有差異

2020/3/4 — 18:20

最新刊於 National Science Review 的中國研究發現,新型冠狀病毒 SARS CoV 2 已有兩個亞型,武漢流傳的是較高感染力亞型,因此成為疫情最嚴重的地方。

該研究由北京大學生命科學學院研究員陸劍領導,團隊從全球共享流感數據倡議組織 (GISAID) 下載 103 個 SARS CoV 2 基因組再進行分析。

團隊指,雖然發現 SARS CoV 2 和蝙蝠相關冠狀病毒 (SARSr-CoV RaTG13) 之間的基因組核苷酸差異僅為 4% ,但兩者基因中性位點 (neutral site) 的差異達到 17% ,表明兩種病毒之間的差異比想像中大。

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團隊研究顯示, SARS CoV 2 與穿山甲身上的相關冠狀病毒病毒受體結合區 (receptor binding domain, RBD) 的功能性位點出現新變異,除了可能由重組造成之外,亦有機會由突變與天擇引起。

團隊又指,從 103 個 SARS CoV 2 基因組的人口基因分析發現, SARS CoV 2 已衍生出兩種主要類型,並將之稱為 L 與 S 。兩者顯示出兩個不同的單核苷酸多態性 (SNPs) ,與迄今已知病毒株基因組有近乎完全的關聯,而在此批基因組中,有共 149 個位點出現突變。團隊指暫時未清楚在疫情中, S 型如何衍生出 L 型 SARS CoV 2 。

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另外,雖然 S 型是較祖先的版本,但 103 個基因組中,有約 70% 是傳播得較快、感染力更強的 L 型。團隊指,在爆發中心的武漢絕大部份感染者都感染 L 型,但武漢以外的 L 型感染比率由 96.3% 跌至 61.6% ;團隊又發現 L 型感染個案在 1 月 7 日後出現頻率已有所下降,這可能與人類干預措施對 L 型施加較大的選擇性壓力。結果,較古老與傳播得較慢的 S 型,因受相對較低的選擇性壓力,其出現頻率在同期開始升高。

從美國與澳洲兩個病人身上的病毒基因發現,有病人可能同時感染 L 與 S 型 SARS CoV 2 ,令 SARS CoV 2 的感染演化過程更為複雜。因此,團隊認為現時有強烈逼切需要,進一步進行結合基因組數據、流行病學數據和臨床症狀記錄的全面研究。

來源:
Tang, X.L., Wu, C.C., Li, X. & et al. (2020). On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2. National Science Review, nwaa036. doi: 10.1093/nsr/nwaa036

文/Alan Chiu 、審核/Edward Ho

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