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【病毒之謎】廣東團隊:穿山甲未必是直接中間宿主

2020/5/16 — 21:05

資料圖片,圖片來源:維基百科

資料圖片,圖片來源:維基百科

香港大學微生物學系教授管軼的團隊曾在三月指,從多個走私穿山甲樣本中發現與引致武漢肺炎 (COVID-19) 冠狀病毒 SARS-CoV-2 相似的近親病毒,顯示穿山甲可能是造成現時疫情的病毒中間宿主。

最新刊於 PLOS Pathogens 的廣東生物資源應用研究所報告,分析另一批廣東充公的馬來穿山甲 (Manis javanica) 其中三隻,同樣確認當中含有類似 SARS-CoV-2 的冠狀病毒,但不認為足以證明穿山甲是 SARS-CoV-2 的中間宿主。

團隊將樣本找到的冠狀病毒拼成幾乎完整基因組,並分離出「2020 年穿山甲冠狀病毒 (pangolin-CoV-2020) 」,此病毒排序有 29,521 個鹼基對 (nucleotide) ,略短過 SARS-CoV-2 的三萬多個。

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團隊又指,該穿山甲冠狀病毒與 SARS-CoV-2 同屬乙型冠狀病毒屬 (Betacoronavirus) ,該屬主要感染哺乳動物。全基因組顯示穿山甲冠狀病毒與 SARS-CoV-2 的基因排序有 90.32% 相似性,而與中菊頭蝠 (Rhinolophus affinis) 冠狀病毒 RaTG13 則為 90.24% 相似,後者仍是 SARS-CoV-2 迄今已知最近親,兩者全基因組相似度達 96.18% 。

基因排序相似性並不能反映冠狀病毒的感染能力:對比 SARS-CoV-2 病毒感染人體最重要的刺蛋白基因,蝙蝠冠狀病毒比穿山甲的更為相似。不過,穿山甲冠狀病毒與 SARS-CoV-2 都是用相同的血管緊張素轉化酵素 2 (ACE2) 受體,另一未受同儕審查的中國研究有同一說法,同樣指 SARS-CoV-2 可能是蝙蝠與穿山甲冠狀病毒的嵌合體 (chimera) 。

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廣東團隊又認為,不同冠狀病毒相似之處表明基因重組事件在不同病毒的演化過程中多次出現,並互相交換基因,但 SARS-CoV-2 、RaTG13 與穿山甲冠狀病毒三種病毒之間演化關係的分析,並不支持人類版本的 SARS-CoV-2 直接從穿山甲身上演化而來。

他們在報告中也指:「在基因組水平上, SARS-CoV-2 基因比『2020 年穿山甲冠狀病毒』與 RaTG13 更為接近。」

無論穿山甲是否為直接中間宿主,團隊指減少人類與野生生物的接觸,對減低動物冠狀病毒傳至人類身上風險非常重要。

來源:
Science Alert, Pangolins May Not Have Been The Intermediary Host of SARS-CoV-2 After All, 14 May 2020

報告:
Liu, P., Jiang, J.Z., Wan, X.F. & et al. (2020). Are pangolins the intermediate host of the 2019 novel coronavirus (SARS-CoV-2)?. PLOS Pathogens. doi: 10.1371/journal.ppat.1008421

文/Alan Chiu

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